KINGDOM PROTEOBAKTERIA

Kingdom Proteobacteria (bakteri gram negative)

1.       Oksidasi-Hidrogen Proteobacteria

Dengan menggunakan gas hidrogen dari donor elektron dan aseptor

O

Sifat : fakultatif kemolithotrops, tetapi bisa juga secara heterotroph.

Memanfaatkan komponen organik dari  sebagai sumber karbon agar dapat tumbuh

Contohnya: Alcaligenes, Raistonia.

2.       Pengurai nitrogen (fiksasi-nitrogen) Proteobacteria.

Genus α Proteobacteria juga termasuk dalam bakteri yang melakukan fiksasi nitrogen. Dari  dan mereduksinya menjadi  (amonia) dan menjadimateri sellular dengan enzin nitrogenase.

Proses pemecahan ATP:

 + +   + 16 ATP →   + 16 ADP + 16 Pi

Bakteri fiksasi nitrogen dapat hidup di tanah : Azobacter (dalam bentuk nitrat)

Simbiosis dengan akar dengan tumbuhan polong atau kacang-kacangan : Rhizobium

Bakteri ini sensitive terhadap sehingga bersifat anaerob. Tetapi masih bisa hidup di aerob karena sel interferon oxigen-free. Anaerob bisa hidup di aerob karena enzim katalase. Tetapi aerob tidak dapat hidup di aerob jika pada manusia

Fiksasi nitrogen hanya dilakukan oleh sedikit species bakteri dan tidak ada eukariotik yang seperti ini karena, eukariotik untuk fiksasi karbon

·         Setelah fiksasi nitrogen lalu akan dilanjutkan oleh TETROBACTERIA oleh molekul α, β, ϒ efsilon.

Procaryote diversity

1.       Phylum Bacteroidetes

No unifiying phenotypic feature characterises this diverse group, but their phylogenetic closeness causes them to be placed together. In light of this, we can only consider example, without claiming them to be in any way representative.

The genus Flavobacterium takes its name from the yellow carotenoid pigments secreated by its members. These are aerobic, free living, aquatic, forms, although they are also associated with food spoilage.

In contrast, Bacteroides spicies are obligate anaerobes found in human gut. Where they ferment undiegested food to acetate or lactate. Here they outnumber all other microbial forms, and are responsible for a significant percentage of the weight of human faeces. Some species can also be pathogenic, and may cause peritonitis in cases where the largeintestine or appendix has become perforated.

Representative genera : Bacteroides, Flavobacterium

2.       Phylum Verrucomicrobia

Members of the Verrucomicrobia form several prosthecae per cell, these are similiar to those described for certain Proteobacteria (see above). Although widespread in teresstrial, freshwater and merine environments, only a handful of representatives have been isolated in pure culture.

Representative genera: Verrucomicrobium, Prosthecobacter.

The gram-possitive bacteria: phylum Firmicutes and phylum Actinobacteria

In the second audition of Bergey, the gram possitive bacteria are divided inti two large phyla, the firmicutes and the Artinobacteria. Some 2500 species are known, but a substantial proporation of these belong to just a handful of genera. Gram possitivebacteria mostly have a chemoheterotropic mode of nutrition and include among their number several important human pathogens, as well as industrially sidnificant forms

They base composition of an organism’s DNA can be expressed as the precentage of cytosine and guanine residues (per cent GC content) ; the tecnique is used widely in microbial taxonomy, and the gram possitive bacteria are devided into those whose GC content is significantly over under 50 per cent. It is convenient to consider groupings within the high GC and low GC forms as follows:

Phylum Firmicutes (low GC) :  1. Spore-forming, 2. Non- spore forming, 3. Mycoplasma

Phylum Actinobacteria ( high GC) : 1. Actinomycetes, 2. Coryneform bacteria

DOMAIN: BACTERIA

The low GC gram-possitive bacteria form volume 3 of the second edition of Bergey.

The spore-forming Gram-possitive bacteria include two large genera, Clostridium and Bacillus. Although not particularly close in phylogenetic terms, they are both capable of propagation by endospores.

Clostridium species are obligate anaerobes, and common inhabitants of soil. Sugars are fermented to various end products such as butyric acid, acetone or butanol. Lacking an electron transport system, they obtain all their ATP form substrate-level phosphorylation.

Several species of Clostridium are serious human pathogens including C. Botulinum (botulism) and C.tetani (tetanus). C perfringens causes gas gangrene  and if ingested, can also result in gastroenteritis. All these condition are due to the production of bacterial exctoxins. The resistance of spores to heating is thus highly relevant both in medicine and in the food industry. Realated to Clostridium are the heliobacteria two genera of anaerobic photoheterotropic rods, some of which produce endospores. They are the only known photosynthetic gram possitive.

Bacillus species are aerobes or facultative anaerobes. They are chemoheterothrops and usually motile by means of peritrichous flagella. Only a few species of Bacillus are pathogenic in humans, notably B. Anthracis, the causative agent of antrax. This is seen by many as a potential agent of bioterrorism and here again the relative indestructibility of its spores is a crucial factors. Other species, conversely are possitively benefecial to humans ; antibiotics such as bacitracin and polymixin are produced by Bacillus species, whilst the toxin from B. Thuringiensis has been used as a natural insecticide. 

Representative genera: Bacillus, Clostridium

Important!!!!

So-called ‘Batox’ injection, much in vague in certain circles as a cosmetic treatment in volve low doses of C.botulinum exotoxin. By acting as a muscle relaxant. They are intended to reduce the facial wrinkles thet develop with the passing at time the toxin is also used to treat medical conditions in which abnormal muscle contraction make it impossible for patients to open their etes properly.

The non spore forming low GC gram-possitive bacteria include a number of medically and industrially significant genera, a few of which are discussed below.

The lactic acid bacteria are taxonomically diverse group containing both rods (Lactobacillus) and cocci (streptococcus, lactococcus) all characterised by their fermentative metabolism with lactic acid as end product. Althought they are able to tolerate oxygen, these bacteria do not use in respiration. They are said to be aerotolerant. Like the clostridia they lack cytochromes and therefore unable to carry out electrons transport phosphorylation. The lactic acid bacteria have limited synthetic capabilities, so they are dependent on a supply of nutrients such as amino acid, purines, pyrimidines and vitamints. There has been growing interest in recent years in the use of certain lactic acid bacteria as probiotics.

Important!!!!

Probiotics are livbg organism that arae deliberately ingested by humans with the aim of promoting health.

Terjemahan :

Keragaman Procaryote

1. filum Bacteroidetes
Tidak ada fitur fenotip  pemersatu yang mencirikan berbagai kelompok, tetapi kedekatan filogenetik mereka menyebabkan mereka ditempatkan bersama-sama. Dalam pembahasan  ini, kita hanya dapat mempertimbangkan contoh, tanpa mengklaim mereka untuk menjadi wakil dalam cara.
Pada  genus Flavobacterium mengambil nama dari pigmen karotenoid kuning yang dikeluarkan oleh anggotanya. Ini adalah aerobik, hidup bebas, air, bentuk, meskipun mereka juga terkait dengan pembusukan makanan.
 spesies Bacteroides adalah anaerob obligat ditemukan dalam usus manusia. Di mana mereka memfermentasi makanan tercerna dalam  asetat atau laktat. Di sini mereka melebihi jumlah semua bentuk mikroba lain, dan bertanggung jawab atas persentase yang signifikan dari berat tinja manusia. Beberapa spesies juga bisa menjadi patogen, dan dapat menyebabkan peritonitis dalam kasus di mana usus besar  atau usus buntu telah menjadi berlubang.
Perwakilan genera: Bacteroides, Flavobacterium

2.filum Verrucomicrobia
Anggota prosthecae bentuk Verrucomicrobia beberapa per sel, ini mirip dengan yang dijelaskan untuk Proteobacteria tertentu (lihat di atas). Meskipun tersebar luas di lingkungan teresstrial, air tawar dan Merine, hanya beberapa perwakilan telah diisolasi dalam kultur murni.
Perwakilan genera: Verrucomicrobium, Prosthecobacter.

Para gram possitive bakteri: Firmicutes filum dan filum Actinobacteria

Pada audisi kedua Bergey, bakteri possitive gram dibagi dua inti filum besar, Firmicutes dan Artinobacteria. Beberapa spesies 2500 diketahui, tetapi sebagian besar dari milik hanya beberapa genera. Bakteri Gram possitive kebanyakan memiliki modus chemoheterotropic gizi dan termasuk di antara jumlah mereka beberapa patogen manusia penting, serta bentuk-bentuk industri sidnificant
Mereka dasar komposisi DNA suatu organisme dapat dinyatakan sebagai prosentase dari residu sitosin dan guanin (per konten persen GC); tecnique digunakan secara luas dalam taksonomi mikroba, dan bakteri possitive gram yang dibagi menjadi mereka yang GC konten secara signifikan atas bawah 50 persen. Hal ini mudah untuk mempertimbangkan pengelompokan dalam GC tinggi dan bentuk GC rendah sebagai berikut:
Filum Firmicutes (GC rendah): 1. Membentuk spora, 2. Non-spora membentuk, 3. Mycoplasma
Actinobacteria Filum (GC tinggi): 1. Actinomycetes, 2. Coryneform bakteri

DOMAIN: BAKTERI

GC rendah gram possitive bakteri membentuk volume 3 edisi kedua Bergey.
Para membentuk spora bakteri Gram-possitive termasuk dua genera besar, Clostridium dan Bacillus. Meskipun tidak terlalu dekat dalam hal filogenetik, mereka berdua mampu propagasi oleh endospora.
Spesies Clostridium adalah anaerob obligat, dan penduduk umum tanah. Gula difermentasi untuk berbagai produk akhir seperti asam butirat, aseton atau butanol. Kurang memiliki sistem transpor elektron, mereka mendapatkan semua bentuk ATP mereka substrat tingkat fosforilasi.
Beberapa spesies Clostridium adalah patogen manusia serius termasuk Botulinum C. (botulisme) dan C.tetani (tetanus). C perfringens menyebabkan gangren gas dan jika tertelan, juga dapat menyebabkan gastroenteritis. Semua kondisi ini disebabkan oleh produksi exctoxins bakteri. Hambatan dari spora pemanasan dengan demikian sangat relevan baik dalam bidang kedokteran dan di industri makanan. Terkait dengan Clostridium adalah dua heliobacteria genera batang photoheterotropic anaerobik, beberapa di antaranya menghasilkan endospora. Mereka adalah gram fotosintesis hanya dikenal possitive.
Spesies Bacillus yang aerob atau anaerob fakultatif. Mereka chemoheterothrops dan biasanya motil dengan flagela peritrichous. Hanya beberapa spesies Bacillus bersifat patogen pada manusia, terutama B. anthracis, agen penyebab antrax. Ini terlihat oleh banyak orang sebagai agen potensial bioterorisme dan di sini lagi dihancurkan relatif spora yang merupakan faktor penting. Spesies lain, sebaliknya adalah possitively benefecial kepada manusia; antibiotik seperti bacitracin dan polymixin diproduksi oleh spesies Bacillus, sedangkan racun dari B. thuringiensis telah digunakan sebagai insektisida alami.
Genera Perwakilan: Bacillus, Clostridium

Penting!
Jadi yang disebut 'Batox' injeksi, banyak yang tidak jelas di kalangan tertentu sebagai pengobatan kosmetik di volve dosis rendah eksotoksin C.botulinum. Dengan bertindak sebagai relaksan otot. Mereka dimaksudkan untuk mengurangi kerutan wajah yang berkembang dengan berjalannya waktu toksin juga digunakan untuk mengobati kondisi medis di mana kontraksi otot yang abnormal membuat tidak mungkin bagi pasien untuk membuka etes dengan baik.
Produksi spora non membentuk rendah GC gram possitive bakteri termasuk sejumlah genera medis dan industri yang signifikan, beberapa di antaranya dibahas di bawah ini.
Bakteri asam laktat merupakan kelompok taksonomi yang beragam yang mengandung kedua batang (Lactobacillus) dan coccus  (Streptococcus, Lactococcus) semua ditandai dengan metabolisme mereka dengan fermentasi asam laktat sebagai produk akhir. Meskipun mereka dapat mentolerir oksigen, bakteri ini tidak digunakan dalam respirasi. Mereka dikatakan aerotolerant. Seperti Clostridia yang mereka tidak memiliki sitokrom dan karena itu tidak dapat melakukan fosforilasi elektron transportasi. Bakteri asam laktat telah membatasi kemampuan sintetis, sehingga mereka tergantung pada pasokan nutrisi seperti asam amino, purin, pirimidin dan vitamints. Ada telah tumbuh bunga dalam beberapa tahun terakhir dalam penggunaan tertentu bakteri asam laktat sebagai probiotik.
Penting!
Probiotik hidup organisme yang sengaja tertelan oleh manusia dengan tujuan untuk mempromosikan kesehatan.